Удаление приглашенного ранее пользователя не означает удаление его учетной записи. Вы можете просто перестать делиться с ними доступом к вашему проекты.
С его аккаунтом ничего не случится — пользователь просто перестанет видеть ваш проект.
Для удаления пользователя из проект нажмите на ⚙ Шестеренку и выберите раздел Пользователи:
В разделе вы можете убрать ранее приглашеного пользователя из проекта: